Хилл: EC50 из логит-фита
Неизвестный агонист. Снимайте эффект E при нескольких концентрациях и получите EC50 из фита logit(E/Emax) от log₁₀ C. Emax известно.
Университет / научные· 24 мин·Похожий симулятор: Биофизика, жидкости и геонаукиДоза–ответ и кривые Хилла
Цель работы
Определить EC50 из E = Emax C^{n_H} / (EC50^{n_H} + C^{n_H}). График logit от log₁₀ C даёт log₁₀ EC50 из отрезка и наклона.
Оборудование
- Неизвестный агонист
- Известный Emax
- Серия концентраций
- Анализ эффекта
Эксперимент
Теория
При E₀ = 0 имеем logit(E/Emax) = ln(E/(Emax−E)) = n_H ln(10) (log₁₀ C − log₁₀ EC50). Наклон равен n_H ln 10, EC50 = 10^{−отрезок/наклон}. Стенд прячет EC50, n_H и живой E. Emax известно. Это лаба по доза–эффект, не Михаэлис–Ментен (фермент).
Ход работы
- Emax зафиксирован и известен (100). Меняете только концентрацию агониста C. Не уходите в хвосты, где E ≈ 0 или E ≈ Emax (логит расходится).
- Запишите. Анализ заносит E с малым шумом. Живых E, EC50 и n_H нет.
- Таблица считает log₁₀ C и logit. Повторите не менее чем для 6 концентраций примерно от 0,3 до 30 вокруг неизвестной середины.
- Аппроксимируйте logit от log₁₀ C; EC50 = 10^{−отрезок/наклон}. Сравните с эталоном.
Вывод
Найденный EC50 согласуется со скрытым агонистом. Основные погрешности: шум анализа и работа вдали от хвостов логита. n_H не оценивается.